平成25年7月のリニューアルオープンに伴い，上部開放型水槽を用いたウェルカム水槽の導入と館全体に水槽照明のLED化を実施した．
ウェルカム水槽は，各地の海岸風景を再現した水槽を7基設置した．水槽の架台高を70㎝に統一し，幼児でもガラス越しに容易に観察できるようにした．架台高を低くしたことで，幼児用の踏み台が必要なくなるなどの利点があった．水槽4基は，ガラス高を60㎝とすることで水槽内部を上方からも観察できる効果を持たせ，干潟をテーマにした水槽では，巣穴が観察できるなどの展示効果が得られた．配管や配線などは擬岩や砂の中へ隠し，来館者によるいたずら防止と視覚効果の向上を意識した．
館全体の水槽照明には，LED照明を積極的に導入した．大水槽や浅瀬，熱帯の海をテーマにした水槽では，高輝度のLED（器具消費電力94Wおよび190WでHID215Wおよび415W相当），深海を再現した水槽ではスポットLED（器具消費電力14WでHID65W相当）を採用した．LED照明の利点として，省エネ効果によるコスト削減，放熱により生じる水温上昇の軽減，波紋効果などが得られた．欠点として，多重影，深度による飼育水の黄ばみ，波紋よる深海演出効果の低下，他色との混ざりにくさなどがあった．これらは，LED照明の多灯，色セロファンや乳白板フィルターの使用，HID併用等の工夫により改善できた．